Fin dal medioevo  il borgo di San Paolo d'Argon è stato un importante polo culturale ed economico per la presenza di un grande monastero benedettino di fondazione cluniacense (XI secolo), fondato dal conte Gisalberto nell'anno 1079. Per alcuni secoli, i territori circostanti furono gestiti dai monaci dell'abbazia stessa, ma dal XV secolo  tutte le proprietà passarono sotto il dominio della Repubblic Di Venzia . Come il resto della provincia, dopo più di tre secoli alla Serenisimasubentro  la napoleonica Repubblica Cisalpina  che ebbe però poca durata, in quanto scalzata dagli austriaci che instaurarono il Regno Lombardo Veneto.

	Dal 1859 , così come tutta la Lombardia, venne annesso all'Italia, seguendo poi tutte le vicende della nuova nazione. Fino ai primi anni del XX secolo il nome del paese era Buzzone, mentre con San Paolo d'Argon si intendeva soltanto il complesso monastico e l'annessa chiesa. Nel 1929  poi il paese fu accorpato in un'unica entità amministrativa con i comuni di Cenate Sopra  e Cenate Sotto , prendendo il nome di Cenate d'Argon. Il tutto durò fino al 1948, quando le tre entità vennero nuovamente scisse in singoli comuni.